指揮所副指揮官李怡德表示，中央各部會持續與地方政府保持密切聯繫，確保各項補助金、獎勵金及生活支持金撥款入帳。此外，由中央各機關及全國各地營造廠商組成的技術支援團隊，預計於10月底結束協助災區民宅修繕及拆除任務，回歸原來地區及工作，但災後復原腳步不會停止，持續由市、縣政府完成家園復原重建各項任務。
指揮所表示，已請市、縣政府持續關懷弱勢族群，並清楚掌握協助情形，除自行修繕外，由臺南市政府協助修繕的弱勢戶計有291戶，已媒合民間團體或政府修繕完成200戶，其他也正持續接洽或施工、備料中；指揮所補充表示，對已媒合修繕尚未完工及未有產權爭議之待拆戶，應逐案列管追蹤，加速於10月底前完工。
針對因產權或個人因素考量尚未決定修繕或拆除，現況仍以帆布暫時擋風遮雨的災屋，李副指揮官要求各市、縣政府要全面清查數量，並請當地區、鄉鎮市公所及村、里幹事主動逐戶傾聽災民心聲，明確向災戶說明政府各項協助機制，並造冊追蹤列管，避免衍生公共安全及環境衛生問題，期望中央地方民間共同合作，保障居民安全並恢復正常生活。